多貨主在出口冷藏貨物裝箱的時候，會將冷藏集裝箱預冷到設定溫度，這種做法其實有可能會對貨物和集裝箱兩者帶來不良影響，是不科學的做法，會因此不能的集裝箱冷藏（凍）運輸。

在進出口冷藏貨物裝箱的時候不要預冷集裝箱，這種情況高溫地區(qū)及夏天高溫季節(jié)裝箱時更要著重注意，好的方法是預冷貨物，然后將貨物從冷庫以及冷藏集裝箱兩者中隔熱通道迅速裝載進集裝箱。

關于冷藏集裝箱預冷：
（1）一般情況冷藏集裝箱不應預冷，因為預冷過的冷藏集裝箱一打開門，外界熱空氣進入冷藏集裝箱遇冷將產(chǎn)生水汽凝結，水滴會損壞貨物外包裝和標簽，在蒸發(fā)器表面凝結的水滴影響制冷量。但在冷庫的溫度與冷藏集裝箱內(nèi)溫度一致，并采用“冷風通道”裝貨時，可以預冷集裝箱。
(2)預檢測試(PTI)：每個冷藏集裝箱在交付使用前應對箱體、制冷系統(tǒng)等進行檢查，冷藏集裝箱清潔、無損壞、制冷系統(tǒng)處于理想狀態(tài)。經(jīng)檢查合格的冷箱應貼有檢查合格標簽。

冷藏集裝箱脫離制冷時間：各種運輸方式之間的交接可能出現(xiàn)短途運輸或制冷系統(tǒng)故障，造成停止制冷。對冷凍和冷藏保鮮貨物短時間地停止制冷狀態(tài)是允許的。許多產(chǎn)品出現(xiàn)幾小時的停止制冷可以接受，但并非所有貨物都如此。對任何冷藏貨物均不允許出現(xiàn)長時間地停止制冷。對特種貨物和溫度靈敏貨物應保持制冷系統(tǒng)連續(xù)工作，避免任何溫度波動造成貨物質(zhì)量下降。

冷藏集裝箱裝箱前準備工作：根據(jù)不同易腐貨物應確認下述事項：理想溫度設定;新鮮空氣換氣量設定;相對濕度設定;運輸總時間;貨物體積;采用的包裝材料和包裝尺寸;所需的文件和單證等。
裝箱前及裝貨時應注意：設定的溫度應正確;設定的新鮮空氣換氣量應正確;設定的相對濕度應正確;裝箱時制冷系統(tǒng)應停止工作;箱內(nèi)堆裝的貨物應低于紅色裝載線和不超出T型槽的垂直面;箱內(nèi)堆裝的貨物應牢固、穩(wěn)妥;箱內(nèi)堆裝貨物的總重量應不超過冷箱允許載重量;冷藏集裝箱裝貨后總重量(包括附屬設備的重量)在運輸途中不應超過任一途經(jīng)國的限重。

冷藏集裝箱除了貨物的設定值和送風、回風溫度外，溫度控制系統(tǒng)還會以錯誤代碼的形式提供有關系統(tǒng)問題的詳細信息。貨物溫度可通過美國農(nóng)業(yè)部（USDA）探測儀記錄，安裝該探測儀是為了符合美國農(nóng)業(yè)部針對水果的運輸?shù)睦洳靥幚沓绦?。托運人放置于所載貨物中的數(shù)據(jù)記錄儀也會記錄大體溫度。當冷藏裝置失靈時，溫度顯示和數(shù)據(jù)記錄將會展示一個逐漸穩(wěn)定的溫度上升直至終達到周圍環(huán)境溫度值過程。再次強調(diào)，感應器只會記錄空氣溫度，而非貨物溫度。貨物將會受到周圍絕熱材料一定的保護，防止受到外部空氣溫度的影響。