近年來，由于抗生素在水產養(yǎng)殖業(yè)中的廣泛應用帶來了許多新的問題，廣譜抗生素藥物的過度使用不僅使病原菌的耐藥性增加，而且對水產品的安全構成威脅。目前乳酸菌在對蝦、魚類等養(yǎng)殖生產中多用于調節(jié)養(yǎng)殖環(huán)境，對疾病的防治起到積極的作用，但隨著人們在養(yǎng)殖飼料中添加乳酸菌來改善水產類養(yǎng)殖動物的和健康水平研究的不斷深入，乳酸菌在水產養(yǎng)殖中發(fā)揮的作用也越來越大。
乳酸菌和其他類益生菌一樣常用作水產動物的生態(tài)改良調節(jié)劑，改善其養(yǎng)殖環(huán)境，抑制或減少有害菌的孳生。它能改善水產養(yǎng)殖環(huán)境，通過競爭性位點結合和產生頡頏物質，達到控制有害病菌增殖的作用，從而提高水產動物本身的抗病能力。

楊勇研究表明，乳酸菌及其代謝產物可以控制鰻弧菌的數量和生長，從而達到控制其導致的多種海水魚類疾病，起到生物防治的作用。乳酸菌是一種非常重要的益生菌，常添加在飼料中使用，通過在動物體內胃腸道等部位的定殖來發(fā)揮作用。益生菌的大量定殖和繁育，一方面抑制有害菌的生長。另一方面其代謝活動也往往產生一些消化酶類、維生素和促生長因子等物質，這些生長促進劑和大量的酶類補充了寄主的營養(yǎng)水平，增加了寄主對飼料的消化和吸收，提高了利用度。
乳酸菌在代謝過程中產生了大量有機酸等酸性物質，從而使得胃腸道保持偏酸性環(huán)境，這恰恰有利于pH 值為酸性的消化酶類的作用，也就加大了營養(yǎng)元素的消化和吸收，還可促進養(yǎng)殖動物對鈣、磷等無機離子的吸收，從而利于骨骼和甲殼發(fā)育。

胡毅等將復合益生菌添加到對蝦基礎飼料中，經飼喂試驗，結果表明，益生菌能提高對蝦腸道消化酶的活力。從血液生化指標來看，對蝦血清蛋白濃度、酚氧化酶活力、溶菌酶活力和總抗氧化力等都有一定提高。

在魚類研究方面，Son等將乳酸菌添加到石斑魚飼料中飼喂4周，石斑魚的增重率和飼料效率都得到了很大提高，A1y等將乳酸菌應用于羅非魚飼料中，經一段時間的喂養(yǎng)，結果發(fā)現羅非魚增重顯著，成活率大大提高。Suzer等將乳酸菌應用于處于仔魚發(fā)育階段的黑鯛中，結果發(fā)現仔魚的生長性能和消化酶活性都得到了一定的提高，這與在鯉魚飼料中應用時消化酶活性(如肝胰臟和腸道的蛋白酶和淀粉酶活性)得到很大改善的試驗結果非常相似。

石軍等從正常鯉魚腸道中分離出了Jyl3乳酸菌和Jyl0節(jié)桿菌(乳桿菌)，并制成了益生菌制劑添加到飼料中投喂鰱魚。研究發(fā)現飼喂乳酸菌制劑的鰱魚血清中白細胞吞噬率與吞噬指數、巨噬細胞吞噬率與E玫瑰花環(huán)形成率均空白對照組，且當遭受病菌攻毒后各試驗處理組的成活率和特異性抗體效價等指標均明顯空白對照組，均說明乳酸菌在增強鰱魚機體力方面具有一定的促進作用。此外，乳酸菌制劑也可以使得雜交鯉魚在較低溫條件的死亡率明顯降低，而且血清總蛋白、γ-球蛋白、血糖量、血脂量、紅細胞脆性、腦膽堿酯酶活性和白細胞吞噬等指標均有所提高。用該制劑飼喂建鯉時，可以發(fā)現各試驗處理組建鯉的紅細胞、血紅蛋白等水平均空白對照組，而耗氧率則低于空白對照組，使其表現出了較好的抗逆性。

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